Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sec23ipQ6NZC7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sec23ipQ6NZC7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sec23ipQ6NZC7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sec23ipQ6NZC7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sec23ipQ6NZC7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sec23ipQ6NZC7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sec23ipQ6NZC7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sec23ipQ6NZC7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sec23ipQ6NZC7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sec23ipQ6NZC7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sec23ipQ6NZC7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sec23ipQ6NZC7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sec23ipQ6NZC7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sec23ipQ6NZC7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sec23ipQ6NZC7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sec23ipQ6NZC7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sec23ipQ6NZC7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sec23ipQ6NZC7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sec23ipQ6NZC7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sec23ipQ6NZC7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sec23ipQ6NZC7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sec23ipQ6NZC7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sec23ipQ6NZC7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sec23ipQ6NZC7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sec23ipQ6NZC7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sec23ipQ6NZC7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sec23ipQ6NZC7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sec23ipQ6NZC7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sec23ipQ6NZC7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sec23ipQ6NZC7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sec23ipQ6NZC7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sec23ipQ6NZC7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sec23ipQ6NZC7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sec23ipQ6NZC7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sec23ipQ6NZC7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sec23ipQ6NZC7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sec23ipQ6NZC7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sec23ipQ6NZC7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sec23ipQ6NZC7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sec23ipQ6NZC7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sec23ipQ6NZC7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sec23ipQ6NZC7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sec23ipQ6NZC7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sec23ipQ6NZC7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sec23ipQ6NZC7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec23ipQ6NZC7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sec23ipQ6NZC7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sec23ipQ6NZC7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sec23ipQ6NZC7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sec23ipQ6NZC7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sec23ipQ6NZC7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sec23ipQ6NZC7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sec23ipQ6NZC7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms