Protein–RNA interactions for Protein: Q6A098

Secisbp2l, Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Secisbp2lQ6A098 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Secisbp2lQ6A098 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Secisbp2lQ6A098 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Secisbp2lQ6A098 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Secisbp2lQ6A098 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Secisbp2lQ6A098 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Secisbp2lQ6A098 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Secisbp2lQ6A098 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Secisbp2lQ6A098 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Secisbp2lQ6A098 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Secisbp2lQ6A098 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Secisbp2lQ6A098 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Secisbp2lQ6A098 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Secisbp2lQ6A098 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Secisbp2lQ6A098 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Secisbp2lQ6A098 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Secisbp2lQ6A098 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Secisbp2lQ6A098 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Secisbp2lQ6A098 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Secisbp2lQ6A098 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Secisbp2lQ6A098 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Secisbp2lQ6A098 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Secisbp2lQ6A098 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Secisbp2lQ6A098 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Secisbp2lQ6A098 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Secisbp2lQ6A098 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Secisbp2lQ6A098 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Secisbp2lQ6A098 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Secisbp2lQ6A098 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Secisbp2lQ6A098 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Secisbp2lQ6A098 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Secisbp2lQ6A098 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Secisbp2lQ6A098 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Secisbp2lQ6A098 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Secisbp2lQ6A098 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Secisbp2lQ6A098 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Secisbp2lQ6A098 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Secisbp2lQ6A098 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Secisbp2lQ6A098 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Secisbp2lQ6A098 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Secisbp2lQ6A098 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Secisbp2lQ6A098 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Secisbp2lQ6A098 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Secisbp2lQ6A098 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Secisbp2lQ6A098 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Secisbp2lQ6A098 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Secisbp2lQ6A098 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Secisbp2lQ6A098 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Secisbp2lQ6A098 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Secisbp2lQ6A098 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Secisbp2lQ6A098 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Secisbp2lQ6A098 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Secisbp2lQ6A098 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Secisbp2lQ6A098 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Secisbp2lQ6A098 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Secisbp2lQ6A098 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Secisbp2lQ6A098 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Secisbp2lQ6A098 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Secisbp2lQ6A098 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Secisbp2lQ6A098 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Secisbp2lQ6A098 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Secisbp2lQ6A098 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Secisbp2lQ6A098 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Secisbp2lQ6A098 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Secisbp2lQ6A098 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Secisbp2lQ6A098 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Secisbp2lQ6A098 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Secisbp2lQ6A098 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Secisbp2lQ6A098 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms