Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga3Q62470 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga3Q62470 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga3Q62470 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga3Q62470 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga3Q62470 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga3Q62470 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga3Q62470 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga3Q62470 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga3Q62470 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga3Q62470 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga3Q62470 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga3Q62470 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga3Q62470 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga3Q62470 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga3Q62470 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itga3Q62470 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga3Q62470 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga3Q62470 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga3Q62470 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga3Q62470 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga3Q62470 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga3Q62470 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga3Q62470 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga3Q62470 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga3Q62470 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga3Q62470 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga3Q62470 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga3Q62470 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga3Q62470 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga3Q62470 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga3Q62470 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga3Q62470 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga3Q62470 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga3Q62470 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga3Q62470 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga3Q62470 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga3Q62470 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga3Q62470 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga3Q62470 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga3Q62470 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga3Q62470 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga3Q62470 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga3Q62470 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga3Q62470 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga3Q62470 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga3Q62470 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga3Q62470 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga3Q62470 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga3Q62470 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga3Q62470 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga3Q62470 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga3Q62470 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga3Q62470 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga3Q62470 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga3Q62470 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga3Q62470 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga3Q62470 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga3Q62470 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga3Q62470 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga3Q62470 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga3Q62470 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga3Q62470 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga3Q62470 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga3Q62470 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga3Q62470 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga3Q62470 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga3Q62470 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga3Q62470 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga3Q62470 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga3Q62470 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga3Q62470 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga3Q62470 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga3Q62470 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga3Q62470 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga3Q62470 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga3Q62470 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga3Q62470 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga3Q62470 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga3Q62470 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga3Q62470 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga3Q62470 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga3Q62470 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga3Q62470 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga3Q62470 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga3Q62470 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga3Q62470 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga3Q62470 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itga3Q62470 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itga3Q62470 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itga3Q62470 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itga3Q62470 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga3Q62470 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga3Q62470 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga3Q62470 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga3Q62470 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga3Q62470 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga3Q62470 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga3Q62470 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga3Q62470 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms