Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sycp1Q62209 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp1Q62209 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp1Q62209 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp1Q62209 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp1Q62209 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sycp1Q62209 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sycp1Q62209 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sycp1Q62209 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sycp1Q62209 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sycp1Q62209 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sycp1Q62209 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sycp1Q62209 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sycp1Q62209 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sycp1Q62209 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sycp1Q62209 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sycp1Q62209 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sycp1Q62209 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Sycp1Q62209 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp1Q62209 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp1Q62209 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp1Q62209 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sycp1Q62209 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sycp1Q62209 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sycp1Q62209 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sycp1Q62209 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sycp1Q62209 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sycp1Q62209 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sycp1Q62209 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sycp1Q62209 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sycp1Q62209 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sycp1Q62209 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sycp1Q62209 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sycp1Q62209 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sycp1Q62209 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sycp1Q62209 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sycp1Q62209 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sycp1Q62209 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sycp1Q62209 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sycp1Q62209 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sycp1Q62209 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sycp1Q62209 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sycp1Q62209 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sycp1Q62209 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sycp1Q62209 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sycp1Q62209 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sycp1Q62209 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp1Q62209 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp1Q62209 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp1Q62209 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp1Q62209 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp1Q62209 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp1Q62209 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sycp1Q62209 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sycp1Q62209 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sycp1Q62209 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sycp1Q62209 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sycp1Q62209 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp1Q62209 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp1Q62209 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp1Q62209 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sycp1Q62209 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp1Q62209 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sycp1Q62209 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp1Q62209 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp1Q62209 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp1Q62209 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp1Q62209 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp1Q62209 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sycp1Q62209 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sycp1Q62209 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sycp1Q62209 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sycp1Q62209 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sycp1Q62209 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sycp1Q62209 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sycp1Q62209 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp1Q62209 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp1Q62209 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms