Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Dsg1aQ61495 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dsg1aQ61495 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dsg1aQ61495 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Dsg1aQ61495 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Dsg1aQ61495 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dsg1aQ61495 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Dsg1aQ61495 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dsg1aQ61495 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dsg1aQ61495 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dsg1aQ61495 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dsg1aQ61495 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dsg1aQ61495 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dsg1aQ61495 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dsg1aQ61495 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dsg1aQ61495 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Dsg1aQ61495 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dsg1aQ61495 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dsg1aQ61495 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dsg1aQ61495 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dsg1aQ61495 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dsg1aQ61495 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Dsg1aQ61495 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dsg1aQ61495 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dsg1aQ61495 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dsg1aQ61495 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dsg1aQ61495 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dsg1aQ61495 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dsg1aQ61495 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dsg1aQ61495 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dsg1aQ61495 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dsg1aQ61495 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dsg1aQ61495 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dsg1aQ61495 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dsg1aQ61495 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dsg1aQ61495 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dsg1aQ61495 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dsg1aQ61495 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dsg1aQ61495 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dsg1aQ61495 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dsg1aQ61495 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Dsg1aQ61495 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dsg1aQ61495 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dsg1aQ61495 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dsg1aQ61495 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dsg1aQ61495 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dsg1aQ61495 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Dsg1aQ61495 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dsg1aQ61495 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dsg1aQ61495 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dsg1aQ61495 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dsg1aQ61495 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dsg1aQ61495 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dsg1aQ61495 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dsg1aQ61495 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dsg1aQ61495 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dsg1aQ61495 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dsg1aQ61495 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dsg1aQ61495 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dsg1aQ61495 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dsg1aQ61495 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dsg1aQ61495 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dsg1aQ61495 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dsg1aQ61495 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dsg1aQ61495 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dsg1aQ61495 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dsg1aQ61495 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dsg1aQ61495 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dsg1aQ61495 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dsg1aQ61495 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dsg1aQ61495 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dsg1aQ61495 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dsg1aQ61495 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dsg1aQ61495 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dsg1aQ61495 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dsg1aQ61495 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dsg1aQ61495 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dsg1aQ61495 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dsg1aQ61495 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dsg1aQ61495 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dsg1aQ61495 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dsg1aQ61495 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dsg1aQ61495 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dsg1aQ61495 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dsg1aQ61495 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dsg1aQ61495 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dsg1aQ61495 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dsg1aQ61495 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dsg1aQ61495 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dsg1aQ61495 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dsg1aQ61495 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dsg1aQ61495 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dsg1aQ61495 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dsg1aQ61495 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dsg1aQ61495 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms