Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 262.8 ms