Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClpbQ60649 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClpbQ60649 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClpbQ60649 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClpbQ60649 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClpbQ60649 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClpbQ60649 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ClpbQ60649 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClpbQ60649 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClpbQ60649 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClpbQ60649 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClpbQ60649 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClpbQ60649 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClpbQ60649 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClpbQ60649 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClpbQ60649 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClpbQ60649 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClpbQ60649 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClpbQ60649 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClpbQ60649 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClpbQ60649 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClpbQ60649 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClpbQ60649 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClpbQ60649 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClpbQ60649 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClpbQ60649 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClpbQ60649 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClpbQ60649 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClpbQ60649 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ClpbQ60649 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClpbQ60649 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ClpbQ60649 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClpbQ60649 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClpbQ60649 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClpbQ60649 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClpbQ60649 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClpbQ60649 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClpbQ60649 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClpbQ60649 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClpbQ60649 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClpbQ60649 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClpbQ60649 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClpbQ60649 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClpbQ60649 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClpbQ60649 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClpbQ60649 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClpbQ60649 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClpbQ60649 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClpbQ60649 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClpbQ60649 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClpbQ60649 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClpbQ60649 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClpbQ60649 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClpbQ60649 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClpbQ60649 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms