Protein–RNA interactions for Protein: Q60595

Xlr3a, X-linked lymphocyte-regulated protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr3aQ60595 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xlr3aQ60595 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xlr3aQ60595 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xlr3aQ60595 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xlr3aQ60595 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xlr3aQ60595 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xlr3aQ60595 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xlr3aQ60595 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xlr3aQ60595 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xlr3aQ60595 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xlr3aQ60595 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xlr3aQ60595 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xlr3aQ60595 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xlr3aQ60595 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xlr3aQ60595 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xlr3aQ60595 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Xlr3aQ60595 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xlr3aQ60595 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xlr3aQ60595 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xlr3aQ60595 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xlr3aQ60595 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xlr3aQ60595 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Xlr3aQ60595 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xlr3aQ60595 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xlr3aQ60595 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xlr3aQ60595 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xlr3aQ60595 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xlr3aQ60595 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xlr3aQ60595 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xlr3aQ60595 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xlr3aQ60595 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xlr3aQ60595 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xlr3aQ60595 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xlr3aQ60595 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms