Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r195Q5SVD6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms