Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Ggnbp2Q5SV77 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30,05■■■□□ 2,4
Ggnbp2Q5SV77 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC30,04■■■□□ 2,4
Ggnbp2Q5SV77 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Ggnbp2Q5SV77 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Ggnbp2Q5SV77 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Ggnbp2Q5SV77 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC30,03■■■□□ 2,4
Ggnbp2Q5SV77 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Ggnbp2Q5SV77 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Ggnbp2Q5SV77 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ggnbp2Q5SV77 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ggnbp2Q5SV77 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,4
Ggnbp2Q5SV77 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Ggnbp2Q5SV77 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30,01■■■□□ 2,39
Ggnbp2Q5SV77 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Ggnbp2Q5SV77 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Ggnbp2Q5SV77 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30■■■□□ 2,39
Ggnbp2Q5SV77 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Ggnbp2Q5SV77 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Ggnbp2Q5SV77 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ggnbp2Q5SV77 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ggnbp2Q5SV77 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ggnbp2Q5SV77 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29,99■■■□□ 2,39
Ggnbp2Q5SV77 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Ggnbp2Q5SV77 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ggnbp2Q5SV77 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ggnbp2Q5SV77 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ggnbp2Q5SV77 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Ggnbp2Q5SV77 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Ggnbp2Q5SV77 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Ggnbp2Q5SV77 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Ggnbp2Q5SV77 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Ggnbp2Q5SV77 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Ggnbp2Q5SV77 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Ggnbp2Q5SV77 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
Ggnbp2Q5SV77 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Ggnbp2Q5SV77 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Ggnbp2Q5SV77 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29,92■■■□□ 2,38
Ggnbp2Q5SV77 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Ggnbp2Q5SV77 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ggnbp2Q5SV77 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ggnbp2Q5SV77 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29,91■■■□□ 2,38
Ggnbp2Q5SV77 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ggnbp2Q5SV77 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Ggnbp2Q5SV77 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Ggnbp2Q5SV77 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Ggnbp2Q5SV77 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29,9■■■□□ 2,38
Ggnbp2Q5SV77 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29,89■■■□□ 2,38
Ggnbp2Q5SV77 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Ggnbp2Q5SV77 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Ggnbp2Q5SV77 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Ggnbp2Q5SV77 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Ggnbp2Q5SV77 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Ggnbp2Q5SV77 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Ggnbp2Q5SV77 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Ggnbp2Q5SV77 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Ggnbp2Q5SV77 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Ggnbp2Q5SV77 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Ggnbp2Q5SV77 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Ggnbp2Q5SV77 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ggnbp2Q5SV77 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29,84■■■□□ 2,37
Ggnbp2Q5SV77 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ggnbp2Q5SV77 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Ggnbp2Q5SV77 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Ggnbp2Q5SV77 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Ggnbp2Q5SV77 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ggnbp2Q5SV77 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Ggnbp2Q5SV77 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Ggnbp2Q5SV77 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Ggnbp2Q5SV77 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Ggnbp2Q5SV77 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Ggnbp2Q5SV77 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29,75■■■□□ 2,35
Ggnbp2Q5SV77 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Ggnbp2Q5SV77 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Ggnbp2Q5SV77 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Ggnbp2Q5SV77 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,5 ms