Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ggnbp2Q5SV77 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Ggnbp2Q5SV77 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Ggnbp2Q5SV77 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ggnbp2Q5SV77 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ggnbp2Q5SV77 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ggnbp2Q5SV77 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Ggnbp2Q5SV77 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ggnbp2Q5SV77 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ggnbp2Q5SV77 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ggnbp2Q5SV77 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ggnbp2Q5SV77 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ggnbp2Q5SV77 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ggnbp2Q5SV77 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Ggnbp2Q5SV77 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ggnbp2Q5SV77 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ggnbp2Q5SV77 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Ggnbp2Q5SV77 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ggnbp2Q5SV77 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ggnbp2Q5SV77 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ggnbp2Q5SV77 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ggnbp2Q5SV77 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ggnbp2Q5SV77 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Ggnbp2Q5SV77 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ggnbp2Q5SV77 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ggnbp2Q5SV77 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ggnbp2Q5SV77 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ggnbp2Q5SV77 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ggnbp2Q5SV77 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ggnbp2Q5SV77 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ggnbp2Q5SV77 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ggnbp2Q5SV77 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ggnbp2Q5SV77 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ggnbp2Q5SV77 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ggnbp2Q5SV77 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Ggnbp2Q5SV77 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ggnbp2Q5SV77 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ggnbp2Q5SV77 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Ggnbp2Q5SV77 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ggnbp2Q5SV77 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ggnbp2Q5SV77 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ggnbp2Q5SV77 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ggnbp2Q5SV77 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ggnbp2Q5SV77 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ggnbp2Q5SV77 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ggnbp2Q5SV77 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ggnbp2Q5SV77 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Ggnbp2Q5SV77 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Ggnbp2Q5SV77 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ggnbp2Q5SV77 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ggnbp2Q5SV77 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ggnbp2Q5SV77 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ggnbp2Q5SV77 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ggnbp2Q5SV77 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ggnbp2Q5SV77 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ggnbp2Q5SV77 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ggnbp2Q5SV77 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ggnbp2Q5SV77 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ggnbp2Q5SV77 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ggnbp2Q5SV77 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ggnbp2Q5SV77 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ggnbp2Q5SV77 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ggnbp2Q5SV77 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ggnbp2Q5SV77 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ggnbp2Q5SV77 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ggnbp2Q5SV77 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ggnbp2Q5SV77 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ggnbp2Q5SV77 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ggnbp2Q5SV77 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ggnbp2Q5SV77 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ggnbp2Q5SV77 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ggnbp2Q5SV77 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Ggnbp2Q5SV77 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ggnbp2Q5SV77 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ggnbp2Q5SV77 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ggnbp2Q5SV77 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms