Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynaQ5G5D5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynaQ5G5D5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynaQ5G5D5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SynaQ5G5D5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SynaQ5G5D5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SynaQ5G5D5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SynaQ5G5D5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynaQ5G5D5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynaQ5G5D5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynaQ5G5D5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SynaQ5G5D5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SynaQ5G5D5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SynaQ5G5D5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SynaQ5G5D5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SynaQ5G5D5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SynaQ5G5D5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SynaQ5G5D5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SynaQ5G5D5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SynaQ5G5D5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynaQ5G5D5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynaQ5G5D5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynaQ5G5D5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SynaQ5G5D5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SynaQ5G5D5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SynaQ5G5D5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SynaQ5G5D5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SynaQ5G5D5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SynaQ5G5D5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SynaQ5G5D5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SynaQ5G5D5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynaQ5G5D5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynaQ5G5D5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynaQ5G5D5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynaQ5G5D5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SynaQ5G5D5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SynaQ5G5D5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.5 ms