Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrc3Q5DU56 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrc3Q5DU56 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrc3Q5DU56 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrc3Q5DU56 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrc3Q5DU56 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrc3Q5DU56 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrc3Q5DU56 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrc3Q5DU56 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc3Q5DU56 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc3Q5DU56 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc3Q5DU56 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrc3Q5DU56 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrc3Q5DU56 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrc3Q5DU56 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrc3Q5DU56 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrc3Q5DU56 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrc3Q5DU56 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrc3Q5DU56 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrc3Q5DU56 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrc3Q5DU56 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrc3Q5DU56 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrc3Q5DU56 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrc3Q5DU56 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrc3Q5DU56 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nlrc3Q5DU56 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc3Q5DU56 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc3Q5DU56 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc3Q5DU56 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrc3Q5DU56 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrc3Q5DU56 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrc3Q5DU56 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrc3Q5DU56 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrc3Q5DU56 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrc3Q5DU56 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrc3Q5DU56 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrc3Q5DU56 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrc3Q5DU56 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrc3Q5DU56 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrc3Q5DU56 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrc3Q5DU56 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrc3Q5DU56 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrc3Q5DU56 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms