Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lrrc43Q3V0L5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lrrc43Q3V0L5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lrrc43Q3V0L5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrrc43Q3V0L5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrrc43Q3V0L5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrrc43Q3V0L5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrrc43Q3V0L5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Lrrc43Q3V0L5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lrrc43Q3V0L5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lrrc43Q3V0L5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lrrc43Q3V0L5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lrrc43Q3V0L5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Lrrc43Q3V0L5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lrrc43Q3V0L5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Lrrc43Q3V0L5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lrrc43Q3V0L5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lrrc43Q3V0L5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lrrc43Q3V0L5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrrc43Q3V0L5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lrrc43Q3V0L5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lrrc43Q3V0L5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lrrc43Q3V0L5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lrrc43Q3V0L5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lrrc43Q3V0L5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lrrc43Q3V0L5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lrrc43Q3V0L5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Lrrc43Q3V0L5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lrrc43Q3V0L5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lrrc43Q3V0L5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lrrc43Q3V0L5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lrrc43Q3V0L5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lrrc43Q3V0L5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lrrc43Q3V0L5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrrc43Q3V0L5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrc43Q3V0L5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrc43Q3V0L5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lrrc43Q3V0L5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lrrc43Q3V0L5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lrrc43Q3V0L5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Lrrc43Q3V0L5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrrc43Q3V0L5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrrc43Q3V0L5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Lrrc43Q3V0L5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lrrc43Q3V0L5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrrc43Q3V0L5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrrc43Q3V0L5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrrc43Q3V0L5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrrc43Q3V0L5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrrc43Q3V0L5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrrc43Q3V0L5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrrc43Q3V0L5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrc43Q3V0L5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrc43Q3V0L5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrc43Q3V0L5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrc43Q3V0L5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrc43Q3V0L5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrc43Q3V0L5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lrrc43Q3V0L5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lrrc43Q3V0L5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrrc43Q3V0L5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrrc43Q3V0L5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrrc43Q3V0L5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrrc43Q3V0L5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrrc43Q3V0L5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrrc43Q3V0L5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lrrc43Q3V0L5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lrrc43Q3V0L5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lrrc43Q3V0L5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrrc43Q3V0L5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrrc43Q3V0L5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrrc43Q3V0L5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrrc43Q3V0L5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrrc43Q3V0L5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrrc43Q3V0L5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrrc43Q3V0L5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrrc43Q3V0L5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrrc43Q3V0L5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrrc43Q3V0L5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrrc43Q3V0L5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrrc43Q3V0L5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrrc43Q3V0L5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrrc43Q3V0L5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrrc43Q3V0L5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrrc43Q3V0L5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrrc43Q3V0L5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrrc43Q3V0L5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrrc43Q3V0L5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrrc43Q3V0L5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms