Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
4933416C03RikQ3V063 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
4933416C03RikQ3V063 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
4933416C03RikQ3V063 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
4933416C03RikQ3V063 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
4933416C03RikQ3V063 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
4933416C03RikQ3V063 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
4933416C03RikQ3V063 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
4933416C03RikQ3V063 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
4933416C03RikQ3V063 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
4933416C03RikQ3V063 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
4933416C03RikQ3V063 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
4933416C03RikQ3V063 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
4933416C03RikQ3V063 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
4933416C03RikQ3V063 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
4933416C03RikQ3V063 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
4933416C03RikQ3V063 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
4933416C03RikQ3V063 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
4933416C03RikQ3V063 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
4933416C03RikQ3V063 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
4933416C03RikQ3V063 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
4933416C03RikQ3V063 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
4933416C03RikQ3V063 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
4933416C03RikQ3V063 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
4933416C03RikQ3V063 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
4933416C03RikQ3V063 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
4933416C03RikQ3V063 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
4933416C03RikQ3V063 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
4933416C03RikQ3V063 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
4933416C03RikQ3V063 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
4933416C03RikQ3V063 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
4933416C03RikQ3V063 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
4933416C03RikQ3V063 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
4933416C03RikQ3V063 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
4933416C03RikQ3V063 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
4933416C03RikQ3V063 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
4933416C03RikQ3V063 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
4933416C03RikQ3V063 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
4933416C03RikQ3V063 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
4933416C03RikQ3V063 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
4933416C03RikQ3V063 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4933416C03RikQ3V063 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4933416C03RikQ3V063 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
4933416C03RikQ3V063 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4933416C03RikQ3V063 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
4933416C03RikQ3V063 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
4933416C03RikQ3V063 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
4933416C03RikQ3V063 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
4933416C03RikQ3V063 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
4933416C03RikQ3V063 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
4933416C03RikQ3V063 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
4933416C03RikQ3V063 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
4933416C03RikQ3V063 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
4933416C03RikQ3V063 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
4933416C03RikQ3V063 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
4933416C03RikQ3V063 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
4933416C03RikQ3V063 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
4933416C03RikQ3V063 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
4933416C03RikQ3V063 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
4933416C03RikQ3V063 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
4933416C03RikQ3V063 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
4933416C03RikQ3V063 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
4933416C03RikQ3V063 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
4933416C03RikQ3V063 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
4933416C03RikQ3V063 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
4933416C03RikQ3V063 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
4933416C03RikQ3V063 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
4933416C03RikQ3V063 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
4933416C03RikQ3V063 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
4933416C03RikQ3V063 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
4933416C03RikQ3V063 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms