Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Skap1Q3UUV5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skap1Q3UUV5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skap1Q3UUV5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Skap1Q3UUV5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms