Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrch2Q3UMG5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrch2Q3UMG5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrch2Q3UMG5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrch2Q3UMG5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrch2Q3UMG5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrch2Q3UMG5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrch2Q3UMG5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrch2Q3UMG5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrch2Q3UMG5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrch2Q3UMG5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrch2Q3UMG5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrch2Q3UMG5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrch2Q3UMG5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrch2Q3UMG5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrch2Q3UMG5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrch2Q3UMG5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrch2Q3UMG5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrch2Q3UMG5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrch2Q3UMG5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrch2Q3UMG5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrch2Q3UMG5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrch2Q3UMG5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrch2Q3UMG5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrch2Q3UMG5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrch2Q3UMG5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrch2Q3UMG5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrch2Q3UMG5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrch2Q3UMG5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrch2Q3UMG5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrch2Q3UMG5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrch2Q3UMG5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrch2Q3UMG5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrch2Q3UMG5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrch2Q3UMG5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrch2Q3UMG5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrch2Q3UMG5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrch2Q3UMG5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrch2Q3UMG5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrch2Q3UMG5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrch2Q3UMG5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrch2Q3UMG5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrch2Q3UMG5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrch2Q3UMG5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrch2Q3UMG5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrch2Q3UMG5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrch2Q3UMG5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrch2Q3UMG5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrch2Q3UMG5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrch2Q3UMG5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrch2Q3UMG5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrch2Q3UMG5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrch2Q3UMG5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrch2Q3UMG5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrch2Q3UMG5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrch2Q3UMG5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrch2Q3UMG5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrch2Q3UMG5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrch2Q3UMG5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrch2Q3UMG5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrch2Q3UMG5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrch2Q3UMG5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrch2Q3UMG5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrch2Q3UMG5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrch2Q3UMG5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrch2Q3UMG5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrch2Q3UMG5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrch2Q3UMG5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrch2Q3UMG5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrch2Q3UMG5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrch2Q3UMG5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrch2Q3UMG5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrch2Q3UMG5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrch2Q3UMG5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrch2Q3UMG5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrch2Q3UMG5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrch2Q3UMG5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrch2Q3UMG5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms