Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Greb1Q3UHK3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Greb1Q3UHK3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Greb1Q3UHK3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Greb1Q3UHK3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Greb1Q3UHK3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Greb1Q3UHK3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Greb1Q3UHK3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Greb1Q3UHK3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Greb1Q3UHK3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Greb1Q3UHK3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Greb1Q3UHK3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Greb1Q3UHK3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Greb1Q3UHK3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Greb1Q3UHK3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Greb1Q3UHK3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Greb1Q3UHK3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.7 ms