Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc58Q3UGP9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc58Q3UGP9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc58Q3UGP9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc58Q3UGP9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc58Q3UGP9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc58Q3UGP9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc58Q3UGP9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc58Q3UGP9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc58Q3UGP9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc58Q3UGP9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc58Q3UGP9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc58Q3UGP9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc58Q3UGP9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc58Q3UGP9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc58Q3UGP9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc58Q3UGP9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc58Q3UGP9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc58Q3UGP9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc58Q3UGP9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc58Q3UGP9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lrrc58Q3UGP9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc58Q3UGP9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc58Q3UGP9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc58Q3UGP9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc58Q3UGP9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc58Q3UGP9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc58Q3UGP9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc58Q3UGP9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc58Q3UGP9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc58Q3UGP9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc58Q3UGP9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc58Q3UGP9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc58Q3UGP9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc58Q3UGP9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc58Q3UGP9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc58Q3UGP9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc58Q3UGP9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc58Q3UGP9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc58Q3UGP9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc58Q3UGP9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc58Q3UGP9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc58Q3UGP9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc58Q3UGP9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc58Q3UGP9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc58Q3UGP9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc58Q3UGP9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc58Q3UGP9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc58Q3UGP9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc58Q3UGP9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc58Q3UGP9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms