Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Pbxip1Q3TVI8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbxip1Q3TVI8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbxip1Q3TVI8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pbxip1Q3TVI8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pbxip1Q3TVI8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pbxip1Q3TVI8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Pbxip1Q3TVI8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pbxip1Q3TVI8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pbxip1Q3TVI8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pbxip1Q3TVI8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Pbxip1Q3TVI8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pbxip1Q3TVI8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Pbxip1Q3TVI8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pbxip1Q3TVI8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pbxip1Q3TVI8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pbxip1Q3TVI8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pbxip1Q3TVI8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Pbxip1Q3TVI8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pbxip1Q3TVI8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pbxip1Q3TVI8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pbxip1Q3TVI8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pbxip1Q3TVI8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pbxip1Q3TVI8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Pbxip1Q3TVI8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pbxip1Q3TVI8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pbxip1Q3TVI8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pbxip1Q3TVI8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pbxip1Q3TVI8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Pbxip1Q3TVI8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pbxip1Q3TVI8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Pbxip1Q3TVI8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pbxip1Q3TVI8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pbxip1Q3TVI8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pbxip1Q3TVI8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pbxip1Q3TVI8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pbxip1Q3TVI8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pbxip1Q3TVI8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pbxip1Q3TVI8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pbxip1Q3TVI8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pbxip1Q3TVI8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pbxip1Q3TVI8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pbxip1Q3TVI8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Pbxip1Q3TVI8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pbxip1Q3TVI8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pbxip1Q3TVI8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pbxip1Q3TVI8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pbxip1Q3TVI8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pbxip1Q3TVI8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pbxip1Q3TVI8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pbxip1Q3TVI8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pbxip1Q3TVI8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pbxip1Q3TVI8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pbxip1Q3TVI8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pbxip1Q3TVI8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pbxip1Q3TVI8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pbxip1Q3TVI8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pbxip1Q3TVI8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pbxip1Q3TVI8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Pbxip1Q3TVI8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pbxip1Q3TVI8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pbxip1Q3TVI8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pbxip1Q3TVI8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pbxip1Q3TVI8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Pbxip1Q3TVI8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Pbxip1Q3TVI8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pbxip1Q3TVI8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pbxip1Q3TVI8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.2 ms