Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlrp4cQ3TKR3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlrp4cQ3TKR3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrp4cQ3TKR3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlrp4cQ3TKR3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlrp4cQ3TKR3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlrp4cQ3TKR3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlrp4cQ3TKR3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlrp4cQ3TKR3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlrp4cQ3TKR3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlrp4cQ3TKR3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrp4cQ3TKR3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrp4cQ3TKR3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlrp4cQ3TKR3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlrp4cQ3TKR3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlrp4cQ3TKR3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlrp4cQ3TKR3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp4cQ3TKR3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp4cQ3TKR3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp4cQ3TKR3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp4cQ3TKR3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrp4cQ3TKR3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrp4cQ3TKR3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrp4cQ3TKR3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrp4cQ3TKR3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrp4cQ3TKR3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nlrp4cQ3TKR3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrp4cQ3TKR3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp4cQ3TKR3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp4cQ3TKR3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp4cQ3TKR3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp4cQ3TKR3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrp4cQ3TKR3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlrp4cQ3TKR3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlrp4cQ3TKR3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlrp4cQ3TKR3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlrp4cQ3TKR3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp4cQ3TKR3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp4cQ3TKR3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp4cQ3TKR3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrp4cQ3TKR3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrp4cQ3TKR3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrp4cQ3TKR3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrp4cQ3TKR3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrp4cQ3TKR3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrp4cQ3TKR3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrp4cQ3TKR3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrp4cQ3TKR3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrp4cQ3TKR3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrp4cQ3TKR3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrp4cQ3TKR3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp4cQ3TKR3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp4cQ3TKR3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp4cQ3TKR3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp4cQ3TKR3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp4cQ3TKR3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrp4cQ3TKR3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrp4cQ3TKR3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp4cQ3TKR3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp4cQ3TKR3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp4cQ3TKR3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp4cQ3TKR3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp4cQ3TKR3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nlrp4cQ3TKR3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp4cQ3TKR3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp4cQ3TKR3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp4cQ3TKR3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp4cQ3TKR3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp4cQ3TKR3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp4cQ3TKR3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp4cQ3TKR3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp4cQ3TKR3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 280.3 ms