Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC93

Hs1bp3, HCLS1-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs1bp3Q3TC93 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hs1bp3Q3TC93 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hs1bp3Q3TC93 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hs1bp3Q3TC93 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Hs1bp3Q3TC93 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hs1bp3Q3TC93 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hs1bp3Q3TC93 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hs1bp3Q3TC93 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hs1bp3Q3TC93 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hs1bp3Q3TC93 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hs1bp3Q3TC93 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hs1bp3Q3TC93 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hs1bp3Q3TC93 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hs1bp3Q3TC93 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hs1bp3Q3TC93 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Hs1bp3Q3TC93 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hs1bp3Q3TC93 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hs1bp3Q3TC93 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hs1bp3Q3TC93 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hs1bp3Q3TC93 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hs1bp3Q3TC93 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hs1bp3Q3TC93 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hs1bp3Q3TC93 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hs1bp3Q3TC93 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hs1bp3Q3TC93 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hs1bp3Q3TC93 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hs1bp3Q3TC93 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hs1bp3Q3TC93 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hs1bp3Q3TC93 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hs1bp3Q3TC93 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hs1bp3Q3TC93 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hs1bp3Q3TC93 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hs1bp3Q3TC93 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hs1bp3Q3TC93 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hs1bp3Q3TC93 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hs1bp3Q3TC93 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hs1bp3Q3TC93 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hs1bp3Q3TC93 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hs1bp3Q3TC93 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hs1bp3Q3TC93 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hs1bp3Q3TC93 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hs1bp3Q3TC93 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hs1bp3Q3TC93 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hs1bp3Q3TC93 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hs1bp3Q3TC93 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hs1bp3Q3TC93 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hs1bp3Q3TC93 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hs1bp3Q3TC93 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hs1bp3Q3TC93 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Hs1bp3Q3TC93 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hs1bp3Q3TC93 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hs1bp3Q3TC93 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hs1bp3Q3TC93 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hs1bp3Q3TC93 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hs1bp3Q3TC93 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Hs1bp3Q3TC93 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hs1bp3Q3TC93 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hs1bp3Q3TC93 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Hs1bp3Q3TC93 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hs1bp3Q3TC93 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hs1bp3Q3TC93 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hs1bp3Q3TC93 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hs1bp3Q3TC93 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hs1bp3Q3TC93 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hs1bp3Q3TC93 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hs1bp3Q3TC93 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hs1bp3Q3TC93 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hs1bp3Q3TC93 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hs1bp3Q3TC93 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hs1bp3Q3TC93 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hs1bp3Q3TC93 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hs1bp3Q3TC93 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hs1bp3Q3TC93 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hs1bp3Q3TC93 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Hs1bp3Q3TC93 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Hs1bp3Q3TC93 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hs1bp3Q3TC93 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hs1bp3Q3TC93 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Hs1bp3Q3TC93 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hs1bp3Q3TC93 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hs1bp3Q3TC93 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hs1bp3Q3TC93 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hs1bp3Q3TC93 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hs1bp3Q3TC93 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hs1bp3Q3TC93 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hs1bp3Q3TC93 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hs1bp3Q3TC93 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Hs1bp3Q3TC93 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Hs1bp3Q3TC93 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hs1bp3Q3TC93 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hs1bp3Q3TC93 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hs1bp3Q3TC93 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Hs1bp3Q3TC93 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hs1bp3Q3TC93 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hs1bp3Q3TC93 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hs1bp3Q3TC93 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Hs1bp3Q3TC93 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hs1bp3Q3TC93 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hs1bp3Q3TC93 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hs1bp3Q3TC93 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.5 ms