Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
V1rd19Q3KNP5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
V1rd19Q3KNP5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms