Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl9Q32KG4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtl9Q32KG4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtl9Q32KG4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtl9Q32KG4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtl9Q32KG4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtl9Q32KG4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtl9Q32KG4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtl9Q32KG4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtl9Q32KG4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtl9Q32KG4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtl9Q32KG4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtl9Q32KG4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtl9Q32KG4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl9Q32KG4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtl9Q32KG4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtl9Q32KG4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl9Q32KG4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl9Q32KG4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl9Q32KG4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl9Q32KG4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtl9Q32KG4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtl9Q32KG4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtl9Q32KG4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtl9Q32KG4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtl9Q32KG4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtl9Q32KG4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtl9Q32KG4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl9Q32KG4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl9Q32KG4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl9Q32KG4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rtl9Q32KG4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rtl9Q32KG4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtl9Q32KG4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtl9Q32KG4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtl9Q32KG4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtl9Q32KG4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtl9Q32KG4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtl9Q32KG4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtl9Q32KG4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtl9Q32KG4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtl9Q32KG4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtl9Q32KG4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtl9Q32KG4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtl9Q32KG4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtl9Q32KG4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtl9Q32KG4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtl9Q32KG4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtl9Q32KG4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtl9Q32KG4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtl9Q32KG4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtl9Q32KG4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtl9Q32KG4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtl9Q32KG4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Rtl9Q32KG4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtl9Q32KG4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtl9Q32KG4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtl9Q32KG4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtl9Q32KG4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtl9Q32KG4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtl9Q32KG4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtl9Q32KG4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl9Q32KG4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl9Q32KG4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl9Q32KG4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl9Q32KG4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl9Q32KG4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtl9Q32KG4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtl9Q32KG4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtl9Q32KG4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtl9Q32KG4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtl9Q32KG4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtl9Q32KG4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtl9Q32KG4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms