Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox13Q04891 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sox13Q04891 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sox13Q04891 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sox13Q04891 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sox13Q04891 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sox13Q04891 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sox13Q04891 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox13Q04891 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox13Q04891 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms