Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RelaQ04207 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RelaQ04207 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RelaQ04207 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RelaQ04207 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RelaQ04207 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RelaQ04207 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RelaQ04207 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RelaQ04207 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RelaQ04207 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RelaQ04207 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RelaQ04207 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RelaQ04207 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RelaQ04207 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RelaQ04207 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RelaQ04207 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RelaQ04207 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RelaQ04207 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RelaQ04207 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RelaQ04207 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RelaQ04207 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RelaQ04207 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RelaQ04207 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RelaQ04207 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RelaQ04207 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RelaQ04207 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RelaQ04207 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RelaQ04207 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RelaQ04207 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RelaQ04207 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RelaQ04207 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RelaQ04207 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RelaQ04207 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RelaQ04207 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RelaQ04207 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RelaQ04207 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RelaQ04207 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RelaQ04207 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RelaQ04207 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RelaQ04207 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RelaQ04207 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RelaQ04207 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RelaQ04207 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RelaQ04207 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RelaQ04207 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RelaQ04207 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RelaQ04207 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RelaQ04207 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RelaQ04207 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RelaQ04207 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RelaQ04207 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RelaQ04207 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms