Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pde1bQ01065 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pde1bQ01065 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pde1bQ01065 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pde1bQ01065 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pde1bQ01065 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pde1bQ01065 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde1bQ01065 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pde1bQ01065 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pde1bQ01065 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pde1bQ01065 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pde1bQ01065 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pde1bQ01065 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pde1bQ01065 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pde1bQ01065 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pde1bQ01065 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pde1bQ01065 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pde1bQ01065 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pde1bQ01065 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pde1bQ01065 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pde1bQ01065 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pde1bQ01065 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde1bQ01065 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde1bQ01065 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde1bQ01065 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde1bQ01065 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde1bQ01065 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde1bQ01065 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde1bQ01065 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde1bQ01065 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde1bQ01065 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde1bQ01065 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde1bQ01065 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde1bQ01065 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde1bQ01065 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde1bQ01065 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde1bQ01065 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde1bQ01065 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde1bQ01065 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde1bQ01065 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde1bQ01065 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde1bQ01065 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde1bQ01065 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde1bQ01065 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms