Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PgrQ00175 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PgrQ00175 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PgrQ00175 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PgrQ00175 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PgrQ00175 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PgrQ00175 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PgrQ00175 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PgrQ00175 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PgrQ00175 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PgrQ00175 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PgrQ00175 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PgrQ00175 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PgrQ00175 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PgrQ00175 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PgrQ00175 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PgrQ00175 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PgrQ00175 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PgrQ00175 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PgrQ00175 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PgrQ00175 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PgrQ00175 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PgrQ00175 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PgrQ00175 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PgrQ00175 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PgrQ00175 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PgrQ00175 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PgrQ00175 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PgrQ00175 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PgrQ00175 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PgrQ00175 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PgrQ00175 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PgrQ00175 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PgrQ00175 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PgrQ00175 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PgrQ00175 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PgrQ00175 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PgrQ00175 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PgrQ00175 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PgrQ00175 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PgrQ00175 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PgrQ00175 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PgrQ00175 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PgrQ00175 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PgrQ00175 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PgrQ00175 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PgrQ00175 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PgrQ00175 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PgrQ00175 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PgrQ00175 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PgrQ00175 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PgrQ00175 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PgrQ00175 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PgrQ00175 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PgrQ00175 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PgrQ00175 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PgrQ00175 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PgrQ00175 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PgrQ00175 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PgrQ00175 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PgrQ00175 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PgrQ00175 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PgrQ00175 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PgrQ00175 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PgrQ00175 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PgrQ00175 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PgrQ00175 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PgrQ00175 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PgrQ00175 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PgrQ00175 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PgrQ00175 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PgrQ00175 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PgrQ00175 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PgrQ00175 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms