Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim43bP86448 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim43bP86448 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim43bP86448 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim43bP86448 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim43bP86448 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim43bP86448 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim43bP86448 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim43bP86448 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim43bP86448 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim43bP86448 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim43bP86448 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim43bP86448 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim43bP86448 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim43bP86448 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim43bP86448 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim43bP86448 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim43bP86448 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim43bP86448 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim43bP86448 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim43bP86448 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim43bP86448 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim43bP86448 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim43bP86448 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim43bP86448 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim43bP86448 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim43bP86448 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim43bP86448 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim43bP86448 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim43bP86448 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim43bP86448 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim43bP86448 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim43bP86448 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim43bP86448 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim43bP86448 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim43bP86448 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim43bP86448 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim43bP86448 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim43bP86448 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim43bP86448 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms