Protein–RNA interactions for Protein: P68037

Ube2l3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2l3P68037 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2l3P68037 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2l3P68037 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2l3P68037 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2l3P68037 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2l3P68037 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2l3P68037 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2l3P68037 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2l3P68037 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2l3P68037 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2l3P68037 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2l3P68037 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2l3P68037 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2l3P68037 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2l3P68037 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2l3P68037 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2l3P68037 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2l3P68037 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2l3P68037 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms