Protein–RNA interactions for Protein: P63137

Gabrb2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb2P63137 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gabrb2P63137 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gabrb2P63137 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gabrb2P63137 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabrb2P63137 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabrb2P63137 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gabrb2P63137 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gabrb2P63137 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gabrb2P63137 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gabrb2P63137 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gabrb2P63137 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gabrb2P63137 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gabrb2P63137 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gabrb2P63137 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gabrb2P63137 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabrb2P63137 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabrb2P63137 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabrb2P63137 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gabrb2P63137 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gabrb2P63137 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabrb2P63137 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabrb2P63137 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabrb2P63137 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabrb2P63137 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabrb2P63137 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gabrb2P63137 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gabrb2P63137 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gabrb2P63137 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabrb2P63137 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabrb2P63137 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabrb2P63137 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabrb2P63137 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabrb2P63137 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabrb2P63137 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabrb2P63137 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabrb2P63137 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabrb2P63137 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabrb2P63137 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabrb2P63137 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabrb2P63137 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabrb2P63137 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabrb2P63137 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabrb2P63137 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gabrb2P63137 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gabrb2P63137 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gabrb2P63137 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabrb2P63137 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabrb2P63137 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabrb2P63137 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabrb2P63137 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabrb2P63137 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabrb2P63137 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabrb2P63137 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabrb2P63137 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabrb2P63137 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabrb2P63137 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gabrb2P63137 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gabrb2P63137 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gabrb2P63137 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gabrb2P63137 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gabrb2P63137 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gabrb2P63137 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gabrb2P63137 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gabrb2P63137 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gabrb2P63137 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gabrb2P63137 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabrb2P63137 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabrb2P63137 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabrb2P63137 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabrb2P63137 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabrb2P63137 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabrb2P63137 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gabrb2P63137 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms