Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp3P63024 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms