Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf13P61216 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf13P61216 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf13P61216 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf13P61216 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf13P61216 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf13P61216 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf13P61216 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Taf13P61216 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Taf13P61216 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Taf13P61216 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Taf13P61216 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Taf13P61216 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Taf13P61216 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Taf13P61216 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Taf13P61216 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Taf13P61216 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Taf13P61216 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Taf13P61216 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Taf13P61216 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Taf13P61216 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Taf13P61216 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Taf13P61216 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Taf13P61216 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Taf13P61216 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Taf13P61216 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf13P61216 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf13P61216 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf13P61216 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf13P61216 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf13P61216 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf13P61216 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf13P61216 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Taf13P61216 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf13P61216 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf13P61216 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf13P61216 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf13P61216 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf13P61216 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Taf13P61216 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf13P61216 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf13P61216 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf13P61216 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf13P61216 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf13P61216 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf13P61216 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Taf13P61216 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf13P61216 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf13P61216 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf13P61216 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf13P61216 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf13P61216 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf13P61216 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf13P61216 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf13P61216 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf13P61216 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf13P61216 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf13P61216 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf13P61216 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf13P61216 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf13P61216 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf13P61216 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf13P61216 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf13P61216 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf13P61216 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf13P61216 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf13P61216 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf13P61216 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf13P61216 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf13P61216 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf13P61216 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf13P61216 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf13P61216 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf13P61216 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms