Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppfia3P60469 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ppfia3P60469 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ppfia3P60469 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ppfia3P60469 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ppfia3P60469 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ppfia3P60469 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ppfia3P60469 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ppfia3P60469 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ppfia3P60469 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ppfia3P60469 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ppfia3P60469 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppfia3P60469 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppfia3P60469 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppfia3P60469 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ppfia3P60469 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ppfia3P60469 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ppfia3P60469 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppfia3P60469 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppfia3P60469 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppfia3P60469 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppfia3P60469 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppfia3P60469 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ppfia3P60469 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppfia3P60469 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppfia3P60469 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppfia3P60469 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppfia3P60469 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppfia3P60469 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppfia3P60469 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppfia3P60469 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppfia3P60469 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppfia3P60469 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppfia3P60469 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppfia3P60469 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppfia3P60469 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppfia3P60469 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppfia3P60469 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppfia3P60469 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppfia3P60469 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppfia3P60469 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppfia3P60469 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppfia3P60469 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppfia3P60469 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppfia3P60469 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppfia3P60469 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppfia3P60469 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppfia3P60469 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppfia3P60469 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppfia3P60469 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppfia3P60469 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppfia3P60469 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppfia3P60469 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppfia3P60469 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppfia3P60469 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppfia3P60469 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppfia3P60469 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppfia3P60469 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppfia3P60469 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppfia3P60469 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppfia3P60469 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppfia3P60469 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppfia3P60469 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppfia3P60469 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppfia3P60469 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppfia3P60469 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppfia3P60469 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppfia3P60469 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppfia3P60469 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppfia3P60469 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppfia3P60469 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppfia3P60469 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppfia3P60469 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppfia3P60469 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppfia3P60469 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppfia3P60469 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppfia3P60469 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms