Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uchl4P58321 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uchl4P58321 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uchl4P58321 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uchl4P58321 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uchl4P58321 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uchl4P58321 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uchl4P58321 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uchl4P58321 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uchl4P58321 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uchl4P58321 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uchl4P58321 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uchl4P58321 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Uchl4P58321 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Uchl4P58321 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uchl4P58321 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uchl4P58321 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uchl4P58321 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uchl4P58321 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uchl4P58321 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uchl4P58321 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Uchl4P58321 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Uchl4P58321 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Uchl4P58321 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Uchl4P58321 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Uchl4P58321 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Uchl4P58321 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Uchl4P58321 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Uchl4P58321 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Uchl4P58321 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Uchl4P58321 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Uchl4P58321 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Uchl4P58321 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Uchl4P58321 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uchl4P58321 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uchl4P58321 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uchl4P58321 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uchl4P58321 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uchl4P58321 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uchl4P58321 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Uchl4P58321 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Uchl4P58321 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Uchl4P58321 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Uchl4P58321 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Uchl4P58321 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Uchl4P58321 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Uchl4P58321 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uchl4P58321 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uchl4P58321 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uchl4P58321 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uchl4P58321 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uchl4P58321 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Uchl4P58321 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uchl4P58321 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uchl4P58321 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms