Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SmoP56726 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SmoP56726 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SmoP56726 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SmoP56726 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SmoP56726 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SmoP56726 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SmoP56726 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SmoP56726 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SmoP56726 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SmoP56726 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SmoP56726 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SmoP56726 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SmoP56726 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SmoP56726 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SmoP56726 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SmoP56726 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SmoP56726 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SmoP56726 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SmoP56726 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SmoP56726 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SmoP56726 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SmoP56726 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SmoP56726 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SmoP56726 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SmoP56726 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SmoP56726 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SmoP56726 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SmoP56726 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SmoP56726 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SmoP56726 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SmoP56726 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SmoP56726 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SmoP56726 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SmoP56726 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SmoP56726 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SmoP56726 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SmoP56726 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SmoP56726 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SmoP56726 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SmoP56726 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SmoP56726 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SmoP56726 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SmoP56726 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SmoP56726 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SmoP56726 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SmoP56726 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SmoP56726 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SmoP56726 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SmoP56726 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SmoP56726 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SmoP56726 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SmoP56726 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SmoP56726 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SmoP56726 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SmoP56726 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SmoP56726 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SmoP56726 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SmoP56726 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SmoP56726 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SmoP56726 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SmoP56726 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SmoP56726 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SmoP56726 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SmoP56726 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SmoP56726 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SmoP56726 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SmoP56726 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SmoP56726 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SmoP56726 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SmoP56726 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SmoP56726 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SmoP56726 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SmoP56726 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SmoP56726 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SmoP56726 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SmoP56726 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SmoP56726 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SmoP56726 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SmoP56726 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SmoP56726 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SmoP56726 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SmoP56726 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SmoP56726 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SmoP56726 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SmoP56726 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SmoP56726 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SmoP56726 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SmoP56726 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SmoP56726 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SmoP56726 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SmoP56726 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SmoP56726 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SmoP56726 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SmoP56726 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SmoP56726 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SmoP56726 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SmoP56726 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SmoP56726 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SmoP56726 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms