Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctbp2P56546 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctbp2P56546 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctbp2P56546 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctbp2P56546 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctbp2P56546 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctbp2P56546 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctbp2P56546 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctbp2P56546 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctbp2P56546 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctbp2P56546 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctbp2P56546 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctbp2P56546 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctbp2P56546 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctbp2P56546 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms