Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp5bP56480 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp5bP56480 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp5bP56480 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp5bP56480 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp5bP56480 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp5bP56480 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp5bP56480 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp5bP56480 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp5bP56480 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp5bP56480 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp5bP56480 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp5bP56480 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp5bP56480 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp5bP56480 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp5bP56480 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp5bP56480 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp5bP56480 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp5bP56480 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp5bP56480 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp5bP56480 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp5bP56480 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp5bP56480 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp5bP56480 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp5bP56480 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp5bP56480 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp5bP56480 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp5bP56480 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp5bP56480 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp5bP56480 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp5bP56480 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp5bP56480 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp5bP56480 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp5bP56480 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp5bP56480 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp5bP56480 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp5bP56480 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp5bP56480 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp5bP56480 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp5bP56480 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp5bP56480 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp5bP56480 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp5bP56480 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp5bP56480 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp5bP56480 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp5bP56480 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp5bP56480 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp5bP56480 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp5bP56480 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp5bP56480 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp5bP56480 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp5bP56480 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp5bP56480 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp5bP56480 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp5bP56480 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp5bP56480 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp5bP56480 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp5bP56480 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp5bP56480 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp5bP56480 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp5bP56480 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp5bP56480 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp5bP56480 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp5bP56480 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp5bP56480 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp5bP56480 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp5bP56480 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp5bP56480 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp5bP56480 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp5bP56480 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp5bP56480 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp5bP56480 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp5bP56480 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 305.1 ms