Protein–RNA interactions for Protein: P56384

Atp5g3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5g3P56384 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp5g3P56384 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5g3P56384 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5g3P56384 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms