Protein–RNA interactions for Protein: P54254

Atxn1, Ataxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn1P54254 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn1P54254 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atxn1P54254 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn1P54254 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn1P54254 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn1P54254 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn1P54254 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn1P54254 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn1P54254 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn1P54254 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn1P54254 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn1P54254 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn1P54254 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn1P54254 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn1P54254 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn1P54254 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn1P54254 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn1P54254 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn1P54254 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn1P54254 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn1P54254 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atxn1P54254 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atxn1P54254 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn1P54254 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn1P54254 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn1P54254 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn1P54254 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn1P54254 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn1P54254 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn1P54254 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn1P54254 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn1P54254 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn1P54254 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn1P54254 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn1P54254 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn1P54254 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn1P54254 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn1P54254 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn1P54254 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn1P54254 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn1P54254 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn1P54254 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn1P54254 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atxn1P54254 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atxn1P54254 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn1P54254 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn1P54254 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atxn1P54254 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atxn1P54254 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atxn1P54254 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atxn1P54254 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn1P54254 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn1P54254 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn1P54254 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn1P54254 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn1P54254 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn1P54254 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn1P54254 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn1P54254 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn1P54254 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn1P54254 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn1P54254 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atxn1P54254 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atxn1P54254 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms