Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fdft1P53798 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fdft1P53798 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fdft1P53798 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Fdft1P53798 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fdft1P53798 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fdft1P53798 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fdft1P53798 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fdft1P53798 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fdft1P53798 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fdft1P53798 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fdft1P53798 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fdft1P53798 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fdft1P53798 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fdft1P53798 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fdft1P53798 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fdft1P53798 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fdft1P53798 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fdft1P53798 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fdft1P53798 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fdft1P53798 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fdft1P53798 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fdft1P53798 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fdft1P53798 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fdft1P53798 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fdft1P53798 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fdft1P53798 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fdft1P53798 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fdft1P53798 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fdft1P53798 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fdft1P53798 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fdft1P53798 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fdft1P53798 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fdft1P53798 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fdft1P53798 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fdft1P53798 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fdft1P53798 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fdft1P53798 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fdft1P53798 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fdft1P53798 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fdft1P53798 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fdft1P53798 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fdft1P53798 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fdft1P53798 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fdft1P53798 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fdft1P53798 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fdft1P53798 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fdft1P53798 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Fdft1P53798 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fdft1P53798 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fdft1P53798 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fdft1P53798 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fdft1P53798 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fdft1P53798 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms