Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Efna1P52793 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efna1P52793 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efna1P52793 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efna1P52793 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efna1P52793 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efna1P52793 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efna1P52793 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efna1P52793 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efna1P52793 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efna1P52793 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efna1P52793 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efna1P52793 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efna1P52793 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efna1P52793 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efna1P52793 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efna1P52793 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efna1P52793 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efna1P52793 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efna1P52793 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efna1P52793 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efna1P52793 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efna1P52793 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efna1P52793 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efna1P52793 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna1P52793 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna1P52793 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna1P52793 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efna1P52793 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efna1P52793 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna1P52793 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna1P52793 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efna1P52793 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efna1P52793 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna1P52793 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Efna1P52793 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna1P52793 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna1P52793 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna1P52793 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna1P52793 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna1P52793 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna1P52793 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Efna1P52793 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Efna1P52793 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Efna1P52793 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Efna1P52793 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Efna1P52793 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efna1P52793 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efna1P52793 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efna1P52793 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efna1P52793 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efna1P52793 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efna1P52793 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efna1P52793 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms