Protein–RNA interactions for Protein: P52480

Pkm, Pyruvate kinase PKM, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkmP52480 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PkmP52480 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PkmP52480 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PkmP52480 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PkmP52480 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PkmP52480 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PkmP52480 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PkmP52480 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PkmP52480 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PkmP52480 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PkmP52480 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PkmP52480 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PkmP52480 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PkmP52480 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PkmP52480 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PkmP52480 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PkmP52480 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PkmP52480 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PkmP52480 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PkmP52480 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PkmP52480 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PkmP52480 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PkmP52480 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PkmP52480 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PkmP52480 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PkmP52480 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PkmP52480 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PkmP52480 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PkmP52480 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PkmP52480 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PkmP52480 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PkmP52480 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PkmP52480 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PkmP52480 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PkmP52480 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PkmP52480 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PkmP52480 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PkmP52480 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PkmP52480 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PkmP52480 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PkmP52480 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PkmP52480 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PkmP52480 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PkmP52480 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PkmP52480 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PkmP52480 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PkmP52480 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PkmP52480 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PkmP52480 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PkmP52480 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PkmP52480 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PkmP52480 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PkmP52480 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PkmP52480 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PkmP52480 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PkmP52480 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PkmP52480 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PkmP52480 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PkmP52480 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PkmP52480 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PkmP52480 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PkmP52480 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PkmP52480 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PkmP52480 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PkmP52480 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PkmP52480 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PkmP52480 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PkmP52480 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PkmP52480 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PkmP52480 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PkmP52480 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PkmP52480 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PkmP52480 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PkmP52480 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PkmP52480 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PkmP52480 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PkmP52480 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PkmP52480 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PkmP52480 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PkmP52480 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PkmP52480 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PkmP52480 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PkmP52480 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PkmP52480 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PkmP52480 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PkmP52480 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PkmP52480 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PkmP52480 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PkmP52480 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PkmP52480 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PkmP52480 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PkmP52480 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PkmP52480 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PkmP52480 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PkmP52480 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PkmP52480 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PkmP52480 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PkmP52480 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PkmP52480 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PkmP52480 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms