Protein–RNA interactions for Protein: P50711

Defa13, Alpha-defensin 13, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa13P50711 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa13P50711 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa13P50711 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa13P50711 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa13P50711 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa13P50711 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa13P50711 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa13P50711 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Defa13P50711 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa13P50711 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa13P50711 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa13P50711 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa13P50711 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa13P50711 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa13P50711 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa13P50711 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa13P50711 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa13P50711 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa13P50711 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa13P50711 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms