Protein–RNA interactions for Protein: P42128

Foxk1, Forkhead box protein K1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxk1P42128 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxk1P42128 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxk1P42128 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxk1P42128 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxk1P42128 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxk1P42128 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxk1P42128 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxk1P42128 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxk1P42128 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxk1P42128 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxk1P42128 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxk1P42128 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxk1P42128 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxk1P42128 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxk1P42128 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxk1P42128 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxk1P42128 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxk1P42128 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Foxk1P42128 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxk1P42128 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Foxk1P42128 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxk1P42128 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxk1P42128 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxk1P42128 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Foxk1P42128 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxk1P42128 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxk1P42128 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxk1P42128 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxk1P42128 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxk1P42128 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxk1P42128 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxk1P42128 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxk1P42128 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Foxk1P42128 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Foxk1P42128 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Foxk1P42128 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxk1P42128 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxk1P42128 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxk1P42128 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxk1P42128 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxk1P42128 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxk1P42128 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxk1P42128 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxk1P42128 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxk1P42128 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxk1P42128 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxk1P42128 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxk1P42128 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxk1P42128 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxk1P42128 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxk1P42128 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxk1P42128 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxk1P42128 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxk1P42128 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxk1P42128 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxk1P42128 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxk1P42128 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxk1P42128 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Foxk1P42128 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxk1P42128 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxk1P42128 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxk1P42128 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxk1P42128 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxk1P42128 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxk1P42128 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxk1P42128 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxk1P42128 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxk1P42128 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxk1P42128 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxk1P42128 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxk1P42128 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxk1P42128 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms