Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elk1P41969 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elk1P41969 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elk1P41969 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elk1P41969 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elk1P41969 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elk1P41969 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elk1P41969 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Elk1P41969 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elk1P41969 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elk1P41969 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elk1P41969 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elk1P41969 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elk1P41969 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elk1P41969 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elk1P41969 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elk1P41969 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elk1P41969 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Elk1P41969 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Elk1P41969 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elk1P41969 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elk1P41969 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elk1P41969 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elk1P41969 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elk1P41969 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elk1P41969 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elk1P41969 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Elk1P41969 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Elk1P41969 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Elk1P41969 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Elk1P41969 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Elk1P41969 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Elk1P41969 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Elk1P41969 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Elk1P41969 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Elk1P41969 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Elk1P41969 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Elk1P41969 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Elk1P41969 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Elk1P41969 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Elk1P41969 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Elk1P41969 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Elk1P41969 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Elk1P41969 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Elk1P41969 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Elk1P41969 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Elk1P41969 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Elk1P41969 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Elk1P41969 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Elk1P41969 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Elk1P41969 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Elk1P41969 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Elk1P41969 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Elk1P41969 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Elk1P41969 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Elk1P41969 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Elk1P41969 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Elk1P41969 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Elk1P41969 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Elk1P41969 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Elk1P41969 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Elk1P41969 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Elk1P41969 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Elk1P41969 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Elk1P41969 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Elk1P41969 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Elk1P41969 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Elk1P41969 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Elk1P41969 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Elk1P41969 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Elk1P41969 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Elk1P41969 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Elk1P41969 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Elk1P41969 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Elk1P41969 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Elk1P41969 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elk1P41969 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Elk1P41969 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms