Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ddit3P35639 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ddit3P35639 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ddit3P35639 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ddit3P35639 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ddit3P35639 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ddit3P35639 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ddit3P35639 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ddit3P35639 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ddit3P35639 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ddit3P35639 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ddit3P35639 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ddit3P35639 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ddit3P35639 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ddit3P35639 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ddit3P35639 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ddit3P35639 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ddit3P35639 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddit3P35639 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddit3P35639 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddit3P35639 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddit3P35639 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddit3P35639 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddit3P35639 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddit3P35639 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddit3P35639 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddit3P35639 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ddit3P35639 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ddit3P35639 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ddit3P35639 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ddit3P35639 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddit3P35639 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddit3P35639 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddit3P35639 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddit3P35639 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddit3P35639 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddit3P35639 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ddit3P35639 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ddit3P35639 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ddit3P35639 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ddit3P35639 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddit3P35639 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddit3P35639 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddit3P35639 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddit3P35639 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddit3P35639 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddit3P35639 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ddit3P35639 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ddit3P35639 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ddit3P35639 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ddit3P35639 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddit3P35639 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddit3P35639 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddit3P35639 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddit3P35639 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddit3P35639 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ddit3P35639 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddit3P35639 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddit3P35639 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddit3P35639 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddit3P35639 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddit3P35639 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddit3P35639 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddit3P35639 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddit3P35639 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddit3P35639 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddit3P35639 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddit3P35639 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddit3P35639 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddit3P35639 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddit3P35639 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddit3P35639 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddit3P35639 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddit3P35639 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddit3P35639 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddit3P35639 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddit3P35639 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddit3P35639 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms