Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Notch4P31695 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Notch4P31695 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Notch4P31695 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Notch4P31695 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Notch4P31695 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Notch4P31695 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Notch4P31695 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Notch4P31695 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Notch4P31695 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Notch4P31695 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Notch4P31695 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Notch4P31695 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Notch4P31695 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Notch4P31695 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Notch4P31695 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Notch4P31695 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Notch4P31695 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Notch4P31695 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Notch4P31695 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Notch4P31695 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Notch4P31695 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Notch4P31695 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Notch4P31695 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Notch4P31695 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Notch4P31695 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Notch4P31695 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Notch4P31695 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Notch4P31695 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Notch4P31695 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Notch4P31695 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Notch4P31695 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Notch4P31695 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Notch4P31695 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Notch4P31695 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Notch4P31695 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Notch4P31695 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Notch4P31695 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Notch4P31695 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Notch4P31695 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Notch4P31695 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Notch4P31695 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Notch4P31695 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Notch4P31695 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Notch4P31695 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Notch4P31695 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Notch4P31695 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Notch4P31695 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Notch4P31695 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Notch4P31695 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms