Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccnd3P30282 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccnd3P30282 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccnd3P30282 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccnd3P30282 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccnd3P30282 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccnd3P30282 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccnd3P30282 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccnd3P30282 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccnd3P30282 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccnd3P30282 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccnd3P30282 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccnd3P30282 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccnd3P30282 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccnd3P30282 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccnd3P30282 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccnd3P30282 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccnd3P30282 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccnd3P30282 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccnd3P30282 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccnd3P30282 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccnd3P30282 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccnd3P30282 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccnd3P30282 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccnd3P30282 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccnd3P30282 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccnd3P30282 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccnd3P30282 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccnd3P30282 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccnd3P30282 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccnd3P30282 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccnd3P30282 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccnd3P30282 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccnd3P30282 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccnd3P30282 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccnd3P30282 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccnd3P30282 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccnd3P30282 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccnd3P30282 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccnd3P30282 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccnd3P30282 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccnd3P30282 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccnd3P30282 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccnd3P30282 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccnd3P30282 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccnd3P30282 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccnd3P30282 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccnd3P30282 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccnd3P30282 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccnd3P30282 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccnd3P30282 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccnd3P30282 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccnd3P30282 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccnd3P30282 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccnd3P30282 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccnd3P30282 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccnd3P30282 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccnd3P30282 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccnd3P30282 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccnd3P30282 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccnd3P30282 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccnd3P30282 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccnd3P30282 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccnd3P30282 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccnd3P30282 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccnd3P30282 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccnd3P30282 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccnd3P30282 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccnd3P30282 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccnd3P30282 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccnd3P30282 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccnd3P30282 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccnd3P30282 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccnd3P30282 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccnd3P30282 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccnd3P30282 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccnd3P30282 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccnd3P30282 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccnd3P30282 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccnd3P30282 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccnd3P30282 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccnd3P30282 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccnd3P30282 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccnd3P30282 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccnd3P30282 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccnd3P30282 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccnd3P30282 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccnd3P30282 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccnd3P30282 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccnd3P30282 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccnd3P30282 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccnd3P30282 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccnd3P30282 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccnd3P30282 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccnd3P30282 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccnd3P30282 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccnd3P30282 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccnd3P30282 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccnd3P30282 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccnd3P30282 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms