Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msr1P30204 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msr1P30204 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msr1P30204 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msr1P30204 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Msr1P30204 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msr1P30204 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msr1P30204 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msr1P30204 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msr1P30204 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msr1P30204 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msr1P30204 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msr1P30204 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msr1P30204 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msr1P30204 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msr1P30204 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msr1P30204 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msr1P30204 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msr1P30204 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msr1P30204 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msr1P30204 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Msr1P30204 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msr1P30204 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msr1P30204 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msr1P30204 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msr1P30204 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msr1P30204 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Msr1P30204 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msr1P30204 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msr1P30204 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msr1P30204 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msr1P30204 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msr1P30204 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msr1P30204 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msr1P30204 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msr1P30204 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msr1P30204 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msr1P30204 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msr1P30204 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msr1P30204 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msr1P30204 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msr1P30204 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msr1P30204 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msr1P30204 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msr1P30204 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msr1P30204 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msr1P30204 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msr1P30204 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Msr1P30204 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msr1P30204 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msr1P30204 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msr1P30204 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msr1P30204 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msr1P30204 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Msr1P30204 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msr1P30204 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msr1P30204 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msr1P30204 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msr1P30204 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msr1P30204 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msr1P30204 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msr1P30204 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msr1P30204 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msr1P30204 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Msr1P30204 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msr1P30204 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msr1P30204 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msr1P30204 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msr1P30204 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msr1P30204 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msr1P30204 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msr1P30204 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msr1P30204 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msr1P30204 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms