Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Marcksl1P28667 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Marcksl1P28667 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Marcksl1P28667 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Marcksl1P28667 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Marcksl1P28667 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Marcksl1P28667 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Marcksl1P28667 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Marcksl1P28667 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Marcksl1P28667 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Marcksl1P28667 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Marcksl1P28667 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Marcksl1P28667 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Marcksl1P28667 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Marcksl1P28667 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Marcksl1P28667 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Marcksl1P28667 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Marcksl1P28667 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Marcksl1P28667 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Marcksl1P28667 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Marcksl1P28667 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Marcksl1P28667 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Marcksl1P28667 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Marcksl1P28667 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Marcksl1P28667 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Marcksl1P28667 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Marcksl1P28667 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Marcksl1P28667 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Marcksl1P28667 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Marcksl1P28667 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Marcksl1P28667 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Marcksl1P28667 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Marcksl1P28667 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Marcksl1P28667 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Marcksl1P28667 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Marcksl1P28667 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Marcksl1P28667 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Marcksl1P28667 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Marcksl1P28667 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Marcksl1P28667 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Marcksl1P28667 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Marcksl1P28667 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Marcksl1P28667 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Marcksl1P28667 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Marcksl1P28667 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Marcksl1P28667 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Marcksl1P28667 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Marcksl1P28667 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Marcksl1P28667 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Marcksl1P28667 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Marcksl1P28667 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Marcksl1P28667 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Marcksl1P28667 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Marcksl1P28667 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Marcksl1P28667 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Marcksl1P28667 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Marcksl1P28667 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Marcksl1P28667 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Marcksl1P28667 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Marcksl1P28667 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Marcksl1P28667 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Marcksl1P28667 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Marcksl1P28667 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Marcksl1P28667 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Marcksl1P28667 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Marcksl1P28667 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Marcksl1P28667 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Marcksl1P28667 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Marcksl1P28667 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Marcksl1P28667 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Marcksl1P28667 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Marcksl1P28667 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Marcksl1P28667 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Marcksl1P28667 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Marcksl1P28667 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Marcksl1P28667 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Marcksl1P28667 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms